Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19 SIVIC

Updated on November 26, 2021 — Licence Ouverte / Open Licence version 2.0

Santé publique France

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique. Créée en mai 2016 par ordonnance et décret, c’est un établissement public administratif sous tutelle du ministère chargé de la Santé. Sa mission : améliorer et protéger la santé des populations. Cette mission s'articule autour de…

21 datasets

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Description

Information 26/11/2021
Ajout de ressources donnant accès aux données hebdomadaires régionales et nationales d'hospitalisation et en fonction de la date d'admission.

Les variables pour covid-hosp-txad-fra.csv et covid-hosp-txad-reg.csv
tx_indic_7J_DC = Nombre de personnes décédées durant les 7 derniers jours
tx_indic_7J_hosp = Nombre de nouvelles hospitalisation los des 7 derniers jours
tx_indic_7J_SC = Nombre d'hospitalisation en soin critique lors des 7 derniers jours
tx_prev_hosp = Nombre total de personnes hospitalisées
tx_prev_SC = Nombre total de personnes en soin critique

En plus pour covid-hosp-txad-age-fra.csv :
cl_age90 = Classe d'âge

Les actions de Santé publique France

Santé publique France a pour mission d'améliorer et de protéger la santé des populations. Durant la crise sanitaire liée à l'épidémie du COVID-19, Santé publique France se charge de surveiller et comprendre la dynamique de l'épidémie, d'anticiper les différents scénarii et de mettre en place des actions pour prévenir et limiter la transmission de ce virus sur le territoire national.

Description du jeu de données

Le présent jeu de données renseigne sur la situation hospitalières concernant l'épidémie de COVID-19.

Cinq fichiers sont proposés :

  • Les données hospitalières relatives à l'épidémie du COVID-19 par département et sexe du patient : nombre de patients hospitalisés, nombre de personnes actuellement en réanimation ou soins intensifs, nombre de personnes actuellement en Soins de Suite et de Réadaptation (SSR) ou Unités de Soins de Longue Durée(USLD), nombre de personnes actuellement en hospitalisation conventionnelle, nombre actuellement de personnes hospitalisées dans un autre type de service ou nombre cumulé de personnes retournées à domicile, nombre cumulé de personnes décédées.

  • Les données hospitalières relatives à l'épidémie du COVID-19 par région, et classe d'âge du patient : nombre de patients hospitalisés, nombre de personnes actuellement en réanimation ou soins intensifs, nombre de personnes actuellement en Soins de Suite et de Réadaptation (SSR) ou Unités de Soins de Longue Durée(USLD), nombre de personnes actuellement en hospitalisation conventionnelle, nombre actuellement de personnes hospitalisées dans un autre type de service, nombre cumulé de personnes retournées à domicile, nombre cumulé de personnes décédées.
    Le codage des classes d'âges est le suivant :
    0 = tous âges
    09 = 0-9 ans
    19 = 10-19 ans
    29 = 20-29 ans
    39 = 30-39 ans
    49 = 40-49 ans
    59 = 50-59 ans
    69 = 60-69 ans
    79 = 70- 79 ans
    89 = 80-89 ans
    90 = 90 ans et plus

  • Les données hospitalières quotidiennes relatives à l'épidémie du COVID-19 par département : nombre quotidien de personnes nouvellement hospitalisées, nombre quotidien de nouvelles admissions en réanimation, nombre quotidien de personnes nouvellement décédées, nombre quotidien de nouveaux retours à domicile.

  • Les données relatives aux établissements hospitaliers par département : nombre cumulé de services ayant déclaré au moins un cas.

  • Les données relatives à les nouvelles admissions en réanimation par région : nombre de nouveaux patients admis en réanimation dans les 24 dernières heures.

Anomalies détectées dans les fichiers

Attention, certains fichiers peuvent comporter des anomalies du fait des difficultés de collecte des données.

Des rapports d'erreurs sont publiés tous les jours par Etalab dans la rubrique ressources communautaires :

À noter que :

  • Le système de déclaration des cas n'est pas exhaustif et le nombre d'établissements déclarant varie au cours du temps ;
  • Certains patients, présents dans la base de données hospitalières à un moment donné, sont retirés de la base de données par les établissements de santé lorsque le résultat biologique du patient est négatif par rapport au COVID-19 ;
  • Pour certains patients, la classe d'âge n'a pas été identifiée dans la base de données. Ce qui peut induire un décalage entre la somme de toutes les classes d'âge d'un indicateur et le nombre total de cet indicateur ;
  • Pour certains patients, le sexe n'a pas été identifié dans la base de données. Ce qui peut induire un décalage entre la somme H/F d'un indicateur et le nombre total de cet indicateur.

N’hésitez pas à signaler d'autres anomalies en commentaire. Ces remarques seront communiquées à l'équipe en charge de la collecte et diffusion des données.

Autres données disponibles

Santé publique France publie également les données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19 et les données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville.

Resources 15

See also: community resources

Main file 9

3743 downloads

donnees-hospitalieres-classe-age-hebdo-covid19-2021-12-02-19h09.csv

Disponible
csv (417.6Ko)

Nombre hebdomadaire selon l'âge d'hospitalisation en fonction de la date d'admission.

Type
Main file
MIME Type
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Created on
September 2, 2021
Modified on
December 2, 2021
Published on
September 2, 2021
64875 downloads

donnees-hospitalieres-covid19-2021-12-07-19h09.csv

Disponible
csv (7.7Mo)
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Main file
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Created on
March 27, 2020
Modified on
December 7, 2021
Published on
March 27, 2020
See the 9 resources of type Main file

Documentation 6

4986 downloads

metadonnees-donnees-hospitalieres-covid19-maj20210810.csv

Disponible
csv (911.0o)
Type
Documentation
MIME Type
text/csv
sha1
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Created on
March 27, 2020
Modified on
August 10, 2021
Published on
March 27, 2020
2831 downloads

metadonnees-donnees-hospitalieres-covid19-classes-age-maj20210810.csv

Disponible
csv (915.0o)
Type
Documentation
MIME Type
text/csv
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Created on
April 8, 2020
Modified on
August 10, 2021
Published on
April 8, 2020

Community resources 38

You have built a more comprehensive database than those presented here? This is the time to share it!

13 downloads

covid-reports-france-2021-05-20.xlsx

Bruno FROUIN

Disponible
xlsx (211.8Ko)

Le rapport de la feuille "Hospi" présente des ratios pour les couples (Région, Classe d'âge) de nombre de personnes hospitalisées ou en soins critique pour 100 kpersonnes de la population totale, de la population non vaccinée, de la population n'ayant pas reçu au mins une injection. L'idée est de suivre la "dangerosité" de l'épidémie pour la part de la population non vaccinée.

Type
MIME Type
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Created on
May 21, 2021
Modified on
May 21, 2021
Published on
May 21, 2021
20 downloads

donnees-hospitalieres-groupees-covid19-2020-10-19-19h00.csv

Valentin Beaulé

Disponible
csv (7.1Ko)

Valeur groupée sans distinction du sexe ni du département basé sur les données du csv donnees-hospitalieres-covid19-2020-10-19-19h00.csv.
Permet de faciliter la création de schéma.

Type
MIME Type
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Created on
October 20, 2020
Modified on
October 20, 2020
Published on
October 20, 2020
208 downloads

Dernier Bilan Covid19 (Coronavirus) et évolutions du nombre de patients - France - 09/09/2020

Disponible
png

Cet été, le nombre de nouveaux patients hospitalisés par million d'habitants (#Incidence) a augmenté dans quasiment toutes les régions. Le #PACA devient le territoire où l'incidence est la plus élevée. Notons la forte progression en #Corse, qui égale désormais #Paris et sa #Région. Cependant, tempérons nos propos sur L'#IledeFrance où le nombre de nouveaux patients reste 20 fois moins élevé qu'au pic de Mars 2020, #PACA 4 fois moins.

Type
MIME Type
None
Created on
September 10, 2020
Modified on
September 24, 2020
Published on
September 10, 2020
134 downloads

01/06/2020 : Bilan Covid19 et projections du nombre de patients

Disponible
png

Bilan de la 3ème semaine après déconfinement phase1. Une épidémie apparemment contrôlée, à confirmer en semaine 3.
Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 22 Juin…

Type
MIME Type
None
Created on
June 2, 2020
Modified on
June 2, 2020
Published on
June 2, 2020
91 downloads

25/05/2020 : Bilan Covid19 et projections du nombre de patients

Disponible
png

Bilan de la 2ème semaine après déconfinement phase1. Une épidémie apparemment contrôlée, à confirmer en semaine 3.
Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 02 Juin…

Type
MIME Type
None
Created on
May 25, 2020
Modified on
May 25, 2020
Published on
May 25, 2020
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17/05/2020 : Bilan Covid19 et projections du nombre de patients

Disponible
png

Vers un déconfinement réussi et une épidémie contrôlée?
Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 02 Juin…

Type
MIME Type
None
Created on
May 18, 2020
Modified on
May 18, 2020
Published on
May 18, 2020
185 downloads

13/05/2020 : Projection du nombre de patients Covid19 hospitalisés / en réa au 02 Juin 2020

Disponible
png

Vers un déconfinement réussi et une épidémie contrôlée?

Type
MIME Type
None
Created on
May 14, 2020
Modified on
May 14, 2020
Published on
May 14, 2020
305 downloads

Dernier Bilan Covid19 (Coronavirus) à l'hôpital, par région, par département - France 10/05/2020

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 02 Juin. Décès hospitaliers cumulés par million d’habitants par département. Hospitalisations par million d’habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
May 11, 2020
Modified on
September 24, 2020
Published on
May 11, 2020
218 downloads

France 07/05/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 11 Mai. Décès hospitaliers cumulés par million d’habitants par département. Hospitalisations par million d’habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
May 8, 2020
Modified on
May 8, 2020
Published on
May 8, 2020
328 downloads

evolution-entrees-hopital-journaliere-au-3-mai.jpg

Philippe Martin

Disponible
jpg (112.4Ko)

Courbe d'évolution des Entrées Journalières à l'Hopital , avec moyenne mobile 7J pour gommer l'effet "Week-End" sur la remontée des chiffres. Calcul de la moyenne hebdomadaire et de sa variation .
Entrée = ( Hospitalisations + Décés + Retour à domicile HDR) du Jour - HDR du Jour précédent.

Type
MIME Type
image/jpeg
sha1
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Created on
May 4, 2020
Modified on
May 4, 2020
Published on
May 4, 2020
34 downloads

entrees-hopital-26-avril-au-2-mai.jpg

Philippe Martin

Disponible
jpg (119.0Ko)

Cartes des Entrées à l'Hopital du 26 avril au 2 Mai par Millions d'habitants par Département et Région

Type
MIME Type
image/jpeg
sha1
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Created on
May 4, 2020
Modified on
May 4, 2020
Published on
May 4, 2020
233 downloads

France 03/05/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 11 Mai. Décès hospitaliers cumulés par million d’habitants par département. Hospitalisations par million d’habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
May 4, 2020
Modified on
May 4, 2020
Published on
May 4, 2020
14 downloads

donnees-deces-hopital-2020-05-07.xlsx

Xavier ILLY

Disponible
xlsx (13.0Ko)

Fichier contenant le nombre de décès à l’hôpital ramené au million d'habitants. La population des départements est celle publiée par l'INSEE pour l'année 2016.

Type
MIME Type
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sha1
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Created on
May 3, 2020
Modified on
May 7, 2020
Published on
May 3, 2020
621 downloads

France 28/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 11 Mai. Décès hospitaliers cumulés par million d’habitants par département. Hospitalisations par million d’habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
April 29, 2020
Modified on
April 29, 2020
Published on
April 29, 2020
404 downloads

France 26/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Projection 11 Mai. Décès hospitaliers cumulés par million d’habitants par département. Hospitalisations par million d’habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
April 27, 2020
Modified on
April 27, 2020
Published on
April 27, 2020
258 downloads

France 23/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Plateau atteint. Décès hospitaliers cumulés par million d’habitants par département. Hospitalisations par million d’habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
April 24, 2020
Modified on
April 24, 2020
Published on
April 24, 2020
267 downloads

France 21/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Plateau atteint en Hospitalisation et réa. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants par département. Hospitalisations par million d'habitants par département.

Type
MIME Type
None
Created on
April 22, 2020
Modified on
April 22, 2020
Published on
April 22, 2020
28 downloads

enrichissement-donnees-covid-19-sante-publique-france-17-aout-2020.zip

François Canellis

Disponible
zip (5.2Mo)

Nouvelle version !!! (09/07) : Ajout d'analyses relatives au déconfinement depuis le 1er Juin

Données actualisées le 17/08/2020 pour les quatre jeux de données (sauf pour données relatives aux tests de dépistage)

site de téléchargement et d'information : https://www.fcafcadata.net/

La réutilisation concerne quatre jeux de données publiés par Santé Publique France:

Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19
Données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville (production interrompue par SPF depuis le 29/05)
Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19 (SI-DEP) (production récente)

Les quatre jeux de données étant à la granularité du département. Le référentiel d'enrichissement est donc identique pour chacun d’entre eux.
Il comporte 17 colonnes qui précèdent celles des données :
Préfecture du dpt, indication de la préfecture de région, latitude et longitude (pour carto), superficie, décès, population INSEE, par tranches d'âge, etc..

J'ai créé un dépôt git : https://github.com/fcafca/Enrichissement-des-donnees-COVID-19-Sante-Publique-France

J’ai démarré la réalisation d’une série de tableaux de bord, avec l’outil libre et open source Apache Superset qui représente une alternative crédible au « poids lourd » du secteur : Tableau.
https://github.com/apache/incubator-superset
Malheureusement, pour l’instant, je ne dispose pas d’une instance dimensionnée pour proposer un accès public à Superset.
Dans l’attente, je publie ces copies d’écran. Trois thèmes sont abordés, dont l'évaluation du déconfinement :

Thème 1 : Evaluation du déconfinement depuis le 1er juin (nouvelle version)

Pour résumer la situation en ce début du mois de Juillet, mis à part en Guyane et à Mayotte, l’épidémie est annoncée comme globalement maîtrisée.
En revanche, le virus est toujours là. La situation est mesurée par Santé Publique France au travers d’un point hebdomadaire publié en fin de semaine.
Le point central d’attention tourne autour des fameux « clusters », et notre capacité à les traiter au fur et à mesure de leurs apparitions.
Le PDF de l’analyse nationale est pour le moins consistant. 31 pages de graphiques accompagnés de commentaires, pour certains assez « obscurs ».

https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/bulletin-national/covid-19-point-epidemiologique-du-17-juillet-2020

Certaines données ne sont pas publiques, notamment celles qui concernent le détail et la localisation des clusters.
Pour celles qui sont accessibles et issues des trois sources disponibles citées en début de page, j’ai pour objectif de reprendre certains de leurs graphiques, en plus « détaillé ».

Le dashboard réalisé est un premier jet, une sorte de brouillon que je compte bien améliorer dans les jours à venir.

Type
MIME Type
application/zip
sha1
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Created on
April 22, 2020
Modified on
August 18, 2020
Published on
April 22, 2020
206 downloads

France 19/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Plateau atteint en Hospitalisation et réa. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants, depuis J0. Hospitalisations et décès par département

Type
MIME Type
None
Created on
April 20, 2020
Modified on
April 22, 2020
Published on
April 20, 2020
378 downloads

France 15/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région, par département

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Par Région. Par Département. Plateau atteint en réa. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants, depuis J0

Type
MIME Type
None
Created on
April 16, 2020
Modified on
April 16, 2020
Published on
April 16, 2020
235 downloads

France 13/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Décalage de 7 jours. Plateau atteint en réa. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants, depuis J0

Type
MIME Type
None
Created on
April 14, 2020
Modified on
April 14, 2020
Published on
April 14, 2020
105 downloads

France 12/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Décalage de 7 jours. Plateau atteint en réa. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants, depuis J0

Type
MIME Type
None
Created on
April 13, 2020
Modified on
April 13, 2020
Published on
April 13, 2020
141 downloads

France 09/04/2020 : Bilan Covid19 à l'hôpital, par région

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Décalage de 7 jours. Plateau atteint en réa. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants, depuis J0

Type
MIME Type
None
Created on
April 10, 2020
Modified on
April 10, 2020
Published on
April 10, 2020
108 downloads

France 08/04/2020 : Décès Covid19 à l'hôpital, par région

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa ou décédés. Décalage de 7 jours. Plateau atteint. Décès hospitaliers cumulés par million d'habitants, depuis J0

Type
MIME Type
None
Created on
April 9, 2020
Modified on
April 9, 2020
Published on
April 9, 2020
140 downloads

France 07/04/2020 : Décès Covid19 à l'hôpital, par région

Disponible
png

Nouveaux patients hospitalisés, en réa, décès. Prévisions. Décès Covid19 à l'hôpital, par région, par habitant. Depuis J0.

Type
MIME Type
None
Created on
April 8, 2020
Modified on
April 8, 2020
Published on
April 8, 2020
12 downloads

french_covid_data_autoflag.py

Thibaut Boissin

Disponible
python

script permettant de détecter les éventuelles erreurs dans les données hospitalières

Type
MIME Type
text/plain
Created on
April 5, 2020
Modified on
April 5, 2020
Published on
April 12, 2020
33 downloads

donnees-hospitalieres-covid19-incoherence-03052020.xlsx

Disponible
xlsx (575.9Ko)
Type
MIME Type
application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
sha1
1d5d4c22c32a07e0e638ec4474bebac713d86af7
Created on
April 1, 2020
Modified on
May 4, 2020
Published on
April 1, 2020
0 downloads

donnees-hospitalieres-etablissements-covid19-incoherence-03052020.xlsx

Disponible
xlsx (8.3Ko)
Type
MIME Type
application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
sha1
de7676a69eace26134d07a100e8fdb1c39c9b19f
Created on
April 1, 2020
Modified on
May 4, 2020
Published on
April 1, 2020
79 downloads

Covid19 Worldwide Mortality as of March 25, 2020

Disponible
png

Covid19 new deaths every 3 days
Mortality rate estimates among diagnosed+ population
Death rate per million inhabitants
Death rate since deaths>10 and >3 per million elderlies

Type
MIME Type
None
Created on
April 1, 2020
Modified on
April 1, 2020
Published on
March 25, 2020
264 downloads

France : Décès Covid19 à l'hôpital, par région - 29 Mars 2020

Disponible
png

Décès Covid19 à l'hôpital par région par million d'habitant - 29 Mars 2020
Comparatif entre régions depuis J0

Type
MIME Type
None
Created on
April 1, 2020
Modified on
April 1, 2020
Published on
March 30, 2020
511 downloads

comparaisons internationales et régions françaices et projections

Corentin Barbu

Disponible
png (25.7Ko)

Projections France d'après un modèle SIR qui marche particulièrement bien pour plusieurs pays:

https://ecosys.versailles-grignon.inra.fr/SpatialAgronomy/covid19/

Type
MIME Type
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Created on
March 30, 2020
Modified on
March 30, 2020
Published on
March 30, 2020
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