Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19

Mis à jour le 27 mars 2020 — Licence Ouverte / Open Licence version 2.0

Santé publique France

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique. Créée en mai 2016 par ordonnance et décret, c’est un établissement public administratif sous tutelle du ministère chargé de la Santé. Sa mission : améliorer et protéger la santé des populations. Cette mission s'articule autour de…

21 jeux de données

Informations

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Description

INFORMATION IMPORTANTE

24/11/2021 En raison d’un mouvement de grève national des associations SOS Médecins donnant lieu à une interruption de la transmission des données, les indicateurs SOS Médecins sont ininterprétables à compter de la journée du 23 novembre 2021. 

Ce jeudi 4 Novembre 2021, le format de la variable sursaud_cl_age_corona sera modifié :

Nouveau codage :
0 = "Tous âges"
1 = "0-4 ans"
2 = "5-14 ans"
3 = "15-44 ans"
4 = "45-64 ans"
5 = "65-74 ans"
6 = "75 ans ou plus"

Ancien actuel :
0 = "Tous âges"
A = "moins de 15ans"
B = "15-44 ans"
C = "45-64 ans"
D = "65-74 ans"
E = "75 ans ou plus"

Les actions de Santé publique France

Santé publique France a pour mission d'améliorer et de protéger la santé des populations. Durant la crise sanitaire liée à l'épidémie du COVID-19, Santé publique France se charge de surveiller et comprendre la dynamique de l'épidémie, d'anticiper les différents scénarii et de mettre en place des actions pour prévenir et limiter la transmission de ce virus sur le territoire national.

Description du jeu de données

Deux fichiers sont proposés :

  • Les données quotidiennes de SOS médecins et des urgences hospitalières par département, sexe et tranche d’âge des patients : nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19, nombre total de passages aux urgences avec un diagnostic médical renseigné, nombre d’hospitalisations parmi les passages aux urgences pour suspicion de COVID-19, nombre total d’actes médicaux SOS Médecins pour suspicion de COVID-19, nombre total d’actes médicaux SOS Médecins avec un diagnostic médical renseigné.

  • Les données quotidiennes de SOS médecins et des urgences hospitalières par région, sexe et tranches d’âge des patients : nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19, nombre total de passages aux urgences avec un diagnostic médical renseigné, nombre d’hospitalisations parmi les passages aux urgences pour suspicion de COVID-19, nombre d’actes médicaux SOS Médecins pour suspicion de COVID-19, nombre total d’actes médicaux SOS Médecins avec un diagnostic médical renseigné. Le code région correspond au code INSEE publié par l’INSEE sur www.data.gouv.fr.

Anomalies détectées dans les fichiers

Attention, certains fichiers peuvent comporter des anomalies du fait des difficultés de collecte des données.

Des rapports d'erreurs sont publiés tous les jours par Etalab dans la rubrique ressources communautaires :

À noter que :

  • Pour certains patients, la classe d’âge n’a pas été identifiée dans la base de données. Ce qui peut induire un décalage entre la somme de toutes les classes d’âge d’un indicateur et le nombre total de cet indicateur ;
  • Pour certains patients, le sexe n’a pas été identifié dans la base de données. Ce qui peut induire un décalage entre la somme H/F d’un indicateur et le nombre total de cet indicateur.

N’hésitez pas à signaler d'autres anomalies en commentaire. Ces remarques seront communiquées à l'équipe en charge de la collecte et diffusion des données.

Autres données disponibles

Santé publique France publie également les données hospitalières relatives à l’épidémie de COVID-19.

Ressources 7

Voir aussi : ressources communautaires

Fichier principal 2

20362 téléchargements

sursaud-covid-quot-dep-2021-12-06-19h09.csv

Disponible
csv (17.3Mo)
Type
Fichier principal
Type MIME
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Créée le
20 mars 2020
Modifiée le
6 décembre 2021
Publiée le
20 mars 2020
3197 téléchargements

sursaud-covid-quot-reg-2021-12-06-19h09.csv

Disponible
csv (3.6Mo)
Type
Fichier principal
Type MIME
text/csv
sha1
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Créée le
20 mars 2020
Modifiée le
6 décembre 2021
Publiée le
20 mars 2020

Documentation 5

268 téléchargements

metadonnee-urgenceshos-sosmedecin-covid19-quot-reg.csv

Disponible
csv (2.6Ko)
Type
Documentation
Type MIME
text/csv
sha1
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Créée le
27 mars 2020
Modifiée le
27 mars 2020
Publiée le
27 mars 2020
287 téléchargements

metadonnee-urgenceshos-sosmedecin-covid19-quot-fra.csv

Disponible
csv (2.6Ko)
Type
Documentation
Type MIME
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Créée le
27 mars 2020
Modifiée le
27 mars 2020
Publiée le
27 mars 2020

Ressources communautaires 8

Vous avez construit une base de données plus complète que celles présentées ici ? C'est le moment de la partager !

326 téléchargements

Covid19 carte interactive France. (Basique)

Geoffrey HARRAZI

Disponible
none (5.0o)

Carte interactive de la France montrant: Le nombre de visites d'urgence pour suspicion de COVID-19 et le nombre de procédures médicales des médecins SOS pour suspicion de COVID-19 jour par jour et par département.

Type
Type MIME
None
Créée le
30 avril 2020
Modifiée le
30 avril 2020
Publiée le
30 avril 2020
11 téléchargements

Covid19 carte interactive France. (Basique)

Geoffrey HARRAZI

Disponible
none (5.0o)

Carte interactive de la France montrant: Le nombre de visites d'urgence pour suspicion de COVID-19 et le nombre de procédures médicales des médecins SOS pour suspicion de COVID-19 jour par jour et par département.

Type
Type MIME
None
Créée le
30 avril 2020
Modifiée le
30 avril 2020
Publiée le
30 avril 2020
9 téléchargements

enrichissement-donnees-covid-19-sante-publique-france-17-aout-2020.zip

François Canellis

Disponible
zip (5.2Mo)

Nouvelle version !!! (09/07) : Ajout d'analyses relatives au déconfinement depuis le 1er Juin

Données actualisées le 17/08/2020 pour les quatre jeux de données (sauf pour données relatives aux tests de dépistage)

site de téléchargement et d'information : https://www.fcafcadata.net/

La réutilisation concerne quatre jeux de données publiés par Santé Publique France:

Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19
Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19
Données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville (production interrompue par SPF depuis le 29/05)
Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19 (SI-DEP) (production récente)

Les quatre jeux de données étant à la granularité du département. Le référentiel d'enrichissement est donc identique pour chacun d’entre eux.
Il comporte 17 colonnes qui précèdent celles des données :
Préfecture du dpt, indication de la préfecture de région, latitude et longitude (pour carto), superficie, décès, population INSEE, par tranches d'âge, etc..

J'ai créé un dépôt git : https://github.com/fcafca/Enrichissement-des-donnees-COVID-19-Sante-Publique-France

J’ai démarré la réalisation d’une série de tableaux de bord, avec l’outil libre et open source Apache Superset qui représente une alternative crédible au « poids lourd » du secteur : Tableau.
https://github.com/apache/incubator-superset
Malheureusement, pour l’instant, je ne dispose pas d’une instance dimensionnée pour proposer un accès public à Superset.
Dans l’attente, je publie ces copies d’écran. Trois thèmes sont abordés, dont l'évaluation du déconfinement :

Thème 1 : Evaluation du déconfinement depuis le 1er juin (nouvelle version)

Pour résumer la situation en ce début du mois de Juillet, mis à part en Guyane et à Mayotte, l’épidémie est annoncée comme globalement maîtrisée.
En revanche, le virus est toujours là. La situation est mesurée par Santé Publique France au travers d’un point hebdomadaire publié en fin de semaine.
Le point central d’attention tourne autour des fameux « clusters », et notre capacité à les traiter au fur et à mesure de leurs apparitions.
Le PDF de l’analyse nationale est pour le moins consistant. 31 pages de graphiques accompagnés de commentaires, pour certains assez « obscurs ».

https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/bulletin-national/covid-19-point-epidemiologique-du-17-juillet-2020

Certaines données ne sont pas publiques, notamment celles qui concernent le détail et la localisation des clusters.
Pour celles qui sont accessibles et issues des trois sources disponibles citées en début de page, j’ai pour objectif de reprendre certains de leurs graphiques, en plus « détaillé ».

Le dashboard réalisé est un premier jet, une sorte de brouillon que je compte bien améliorer dans les jours à venir.

Type
Type MIME
application/zip
sha1
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Créée le
22 avril 2020
Modifiée le
18 août 2020
Publiée le
22 avril 2020
0 téléchargements

sursaud-covid19-quotidien-incoherence-03052020.xlsx

Disponible
xlsx (649.2Ko)
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Type MIME
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sha1
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Créée le
1 avril 2020
Modifiée le
4 mai 2020
Publiée le
1 avril 2020
3 téléchargements

sursaud-covid19-hebdomadaire-incoherence-29042020.xlsx

Disponible
xlsx (20.5Ko)
Type
Type MIME
application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
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f500315ea08bb9c4a7885809a35961eecb6aed02
Créée le
1 avril 2020
Modifiée le
4 mai 2020
Publiée le
1 avril 2020
4893 téléchargements

Carte animée du nombre de personnes en réanimation

Guillaume Rozier

Disponible
gif

Cette carte présente le nombre de personnes actuellement en réanimation dans chaque département. Ce nombre est rapporté au nombre d'habitants dans le département.

Type
Type MIME
None
Créée le
29 mars 2020
Modifiée le
29 mars 2020
Publiée le
29 mars 2020
300 téléchargements

out.json.gz

Mathias Maestri

Disponible
json.gz (1.0Mo)

Ce fichier au format JSON est la compilation des nombreux fichiers présents sur le site concaténés en 1 seul.

Type
Type MIME
application/json
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Créée le
25 mars 2020
Modifiée le
19 juin 2020
Publiée le
25 mars 2020
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