Données hospitalières relatives à l'épidémie de COVID-19 SIVIC

Description

Dans un contexte d’épidémie favorable, à compter du 1er juillet 2023, le cadre juridique actuellement en cours prévoit l’arrêt du traitement des données personnelles issues de SI-DEP. Par conséquent, après une période transitoire d’ajustement de deux semaines, les nouveaux indicateurs de surveillance virologique seront publiés aux niveaux national, régional et départemental) à une fréquence hebdomadaire.
Les consignes de saisie spécifiques dans SI-VIC seront levées à partir de cette date, les indicateurs hospitaliers ne seront plus disponibles.
Santé publique France maintient la surveillance de l’épidémie à travers son dispositif multi-sources. Les indicateurs relatifs à la surveillance génomique, aux recours aux associations SOS Médecins, aux urgences hospitalières et aux décès resteront disponibles.

04/04/2023
Suite aux adaptations des consignes de saisie des données observées par les établissements de santé, Santé publique France publie fait évoluer sa restitution des indicateurs de la surveillance hospitalière de COVID-19 issus de SIVIC tel que :

sont suspendus les indicateurs calculés par date de déclaration
sont maintenus les indicateurs calculés par date d’admission à un rythme bihebdomadaire, les mardi et vendredi.

Les ressources toujours actualisées :

covid_hosp_txad_fra
covid_hosp_ad_age
covid_hosp_txad_reg
covid_hosp_txad_age_fra

08/06/2022 Compte tenu de la tendance actuelle favorable et la baisse des principaux indicateurs, à partir du 11 juin 2022, les indicateurs COVID-19 produits par Santé publique France seront actualisés sur Géodes et data.gouv.fr tous les jours à l’exception des week-end et des jours fériés.

Information 11/03/2022
Le nom de fichiers a été modifié, suite à la mise à jour du système informatique :
donnees-hospitalieres-covid19 devient covid_hospit
donnees-hospitalieres-etablissements-covid19 devient covid_hospit_etab
donnees-hospitalieres-nouveaux-covid19 devient covid_hospit_incid
donnees-hospitalieres-classe-age-covid19 devient covid_hospit_clage10
donnees-hospitalieres-classe-age-hebdo-covid19 devient covid_hosp_ad_age

Information 04/02/2022
Depuis mardi 1er février, les formats des fichiers décès dans SIVIC ont été modifiés en amont de Santé publique France. Certaines données n’ont pas été dans nos indicateurs, entrainant une sous-estimation des indicateurs hospitaliers les 2 et 3 février.

Les nombres de nouvelles hospitalisations, admissions en soins critiques et décès déclarés le 4 Février 2022 intègrent un rattrapage de données et sont donc surestimés.

Information 31/01/2022
Ajout de la variable pouravec dans les fichiers covid-hosp-txad-fra.csv, covid-hosp-txad-reg.csv et covid-hosp-txad-age-fra.csv
Cette variable permet une sélection selon le lien de l'hospitalisation avec la COVID-19 :

0 = Hospitalisations avec infection SARS-CoV-2 (quelque soit le motif de l'hospitalisation)
1 = Hospitalisations pour COVID-19
2 = Hospitalisations pour autre motif, avec infection SARS-CoV-2

(la modalité "0" est la somme des modalités "1" et "2")

SI-VIC est un outil administratif de gestion hospitalière et ne contient aucune information médicale. Les décès notifiés dans SI-VIC ne comprennent donc aucune information concernant l'imputabilité de la Covid-19 au décès. La distinction des patients décédés au cours d'une hospitalisation pour COVID-19 de ceux décédés au cours d'une hospitalisation pour un autre motif mais avec une infection SARS-CoV-2 ne peut donc être faite en se basant sur les données SI-VIC

Information 26/11/2021
Ajout de ressources donnant accès aux données hebdomadaires régionales et nationales d'hospitalisation et en fonction de la date d'admission.

Les variables pour covid-hosp-txad-fra.csv et covid-hosp-txad-reg.csv
tx_indic_7J_DC = Taux de personnes décédées durant les 7 derniers jours (pour 100 000 hab.)
tx_indic_7J_hosp = Taux de nouvelles hospitalisation lors des 7 derniers jours (pour 100 000 hab.)
tx_indic_7J_SC = Taux de nouvelles hospitalisation en soins critiques lors des 7 derniers jours (pour 100 000 hab.)
tx_prev_hosp = Taux personnes hospitalisées (pour 100 000 hab.)
tx_prev_SC = Taux de personnes en soins critiques (pour 100 000 hab.)

En plus pour covid-hosp-txad-age-fra.csv :
cl_age90 = Classe d'âge

Les actions de Santé publique France

Santé publique France a pour mission d'améliorer et de protéger la santé des populations. Durant la crise sanitaire liée à l'épidémie du COVID-19, Santé publique France se charge de surveiller et comprendre la dynamique de l'épidémie, d'anticiper les différents scénarii et de mettre en place des actions pour prévenir et limiter la transmission de ce virus sur le territoire national.

Description du jeu de données

Le présent jeu de données renseigne sur la situation hospitalières concernant l'épidémie de COVID-19.

Cinq fichiers sont proposés :

Les données hospitalières relatives à l'épidémie du COVID-19 par département et sexe du patient : nombre de patients hospitalisés, nombre de personnes actuellement en réanimation ou soins intensifs, nombre de personnes actuellement en Soins de Suite et de Réadaptation (SSR) ou Unités de Soins de Longue Durée(USLD), nombre de personnes actuellement en hospitalisation conventionnelle, nombre actuellement de personnes hospitalisées dans un autre type de service ou nombre cumulé de personnes retournées à domicile, nombre cumulé de personnes décédées.
Les données hospitalières relatives à l'épidémie du COVID-19 par région, et classe d'âge du patient : nombre de patients hospitalisés, nombre de personnes actuellement en réanimation ou soins intensifs, nombre de personnes actuellement en Soins de Suite et de Réadaptation (SSR) ou Unités de Soins de Longue Durée(USLD), nombre de personnes actuellement en hospitalisation conventionnelle, nombre actuellement de personnes hospitalisées dans un autre type de service, nombre cumulé de personnes retournées à domicile, nombre cumulé de personnes décédées.
Le codage des classes d'âges est le suivant :
0 = tous âges
09 = 0-9 ans
19 = 10-19 ans
29 = 20-29 ans
39 = 30-39 ans
49 = 40-49 ans
59 = 50-59 ans
69 = 60-69 ans
79 = 70- 79 ans
89 = 80-89 ans
90 = 90 ans et plus
Les données hospitalières quotidiennes relatives à l'épidémie du COVID-19 par département : nombre quotidien de personnes nouvellement hospitalisées, nombre quotidien de nouvelles admissions en réanimation, nombre quotidien de personnes nouvellement décédées, nombre quotidien de nouveaux retours à domicile.
Les données relatives aux établissements hospitaliers par département : nombre cumulé de services ayant déclaré au moins un cas.
Les données relatives à les nouvelles admissions en réanimation par région : nombre de nouveaux patients admis en réanimation dans les 24 dernières heures.

Anomalies détectées dans les fichiers

Attention, certains fichiers peuvent comporter des anomalies du fait des difficultés de collecte des données.

Des rapports d'erreurs sont publiés tous les jours par Etalab dans la rubrique ressources communautaires :

À noter que :

Le système de déclaration des cas n'est pas exhaustif et le nombre d'établissements déclarant varie au cours du temps ;
Certains patients, présents dans la base de données hospitalières à un moment donné, sont retirés de la base de données par les établissements de santé lorsque le résultat biologique du patient est négatif par rapport au COVID-19 ;
Pour certains patients, la classe d'âge n'a pas été identifiée dans la base de données. Ce qui peut induire un décalage entre la somme de toutes les classes d'âge d'un indicateur et le nombre total de cet indicateur ;
Pour certains patients, le sexe n'a pas été identifié dans la base de données. Ce qui peut induire un décalage entre la somme H/F d'un indicateur et le nombre total de cet indicateur.

N’hésitez pas à signaler d'autres anomalies en commentaire. Ces remarques seront communiquées à l'équipe en charge de la collecte et diffusion des données.

Autres données disponibles

Santé publique France publie également les données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l'épidémie de COVID-19 et les données relatives aux tests de dépistage de COVID-19 réalisés en laboratoire de ville.

Producteur: Santé publique France
Licence: Licence Ouverte / Open Licence version 2.0
Dernière mise à jour: 30 juin 2023

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332 discussions dont 1 clotûrée

Données plus actualisées depuis le 31 mars 2023

Pierre-Édouard Cailliau

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Posté le 21 mai 2023

Le jeu de données 63352e38-d353-4b54-bfd1-f1b3ee1cabd7 covid-hospit-YYYY-MM-JJ-HHhmm.csv (et d'autres) n'a pas été mis à jour depuis le 31 mars 2023 sans explications. Quand sera-t-il mise jour à nouveau et régulièrement ?

Fichier non actualisé

Gérard Mercuriali

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Posté le 18 avril 2023

Bonjour Je remarque que depuis le 31 mars , le fichier covid-hospit-2023-03-31-18h01.csv n'est plus actualisé . Y-a-t-il une explication et peut-on espérer une actualisation prochaine de ce fichier ? Merci Cordialement

Gérard Mercuriali

—

Posté le 4 mai 2023

Je vais me répondre à moi-même puisque personne ne le fait. Le 4 mai 2023, le fichier covid-hospit-2023-03-31-18h01.csv n'est toujours pas actualisé.

Chiffres 8 février 2023

Anthony Piton

—

Posté le 10 février 2023

Les chiffres du 8 février 2023 aboutissent à des résultats incohérents, les entrées étant tellement élevées que la moyenne glissante des entrées en hospitalisation passe du jour au lendemain de 282 à 707, et la moyenne glissante des entrées en réanimation passe du jour au lendemain de 25 à 71. Y a-t-il eu un rattrapage de données ? Si oui, cela rattrape quelle période ? Je sais qu'en 2020 un hôpital avait donné en 1 jour ses données des deux derniers mois, ce qui avait faussé les chiffres. Merci, Anthony

Michel MARTIN

—

Posté le 4 mars 2023

Bonsoir, les données du 04/02/23 ne sont pas plus cohérentes, puisque le total des guérisons, pour la France, est un nombre inférieur de 2656 par rapport à la veille. Il semblerait que les chiffres du 08/02 "rattrapent" ceux du 04/02. Quant à la date du 05/02/23, on ne voit, sur l'ensemble de la France, QUE 10 nouvelles hospitalisations, 1 nouvelle REA, 0 décès, et 9 guérisons. Michel

Anthony Piton

—

Posté le 6 mars 2023

Bonsoir Michel, je ne sais pas comment vous avez compté les guérisons le 04/02/2023, mais je n'ai pas le même chiffre que vous. Moi je calcule en faisant la différence entre le nombre d'hospitalisés le jour J et le nombre d'hospitalisés le jour J-1, auquel je retranche le nombre d'entrées en hôpital le jour J, ce qui me donne le nombre de sorties (en négatif) le jour J. Parmi ces sorties il y a malheureusement des décès, donc ce chiffre est majorant. J'obtiens 168 sorties d'hôpital le 04/02/2023. Par ailleurs le fait que le 5 février on ne voie, sur l'ensemble de la France, que 10 nouvelles hospitalisations, 1 nouvelle REA et 0 décès n'est pas un problème, car il y un effet de déclarations administratives des établissements de santé, qui déclarent pour certains par exemple le lundi les entrées en hôpital survenues durant le week-end. Le samedi et surtout le dimanche sont donc sous déclarés. Le 5 février étant un dimanche, c'est assez normal. Pour passer outre ce problème il faut lisser les chiffres sur 7 jours, cela permet de gommer ces effets. On constate alors que le 5 février n'est pas une anomalie statistique. Le 8 février l'est, car lorsqu'on regarde les chiffres lissés sur 7 jours, il y a clairement une forte discontinuité dans les chiffres, provoquée par des chiffres anormalement grands ce jour là. Anthony.

Michel MARTIN

—

Posté le 6 mars 2023

Bonjour Anthony, je n'ai pas calculé ces chiffres, je ne fais que récupérer ceux fournis par la base de données. Il y a les chiffres du jour, et les chiffres cumulés. Les chiffres par département, les chiffres par région. Ceux absents pour une région sont alors calculés par addition de leurs départements respectifs. Pour les guérisons du jour, le fichier "covid-hosp-incid" donne les guérisons dans la colonne "incid_rad". Par contre, dans mes tableaux, j'ajoute une colonne qui effectue le total des colonnes "hospitalisés + guéris + décès" pour contrôle par rapport aux nouveaux cas. Et il n'y a jamais le même nombre!! Ensuite j'extrais les chiffres que je considère plus "opportuns" pour moi, comme ceux de ma région et ceux des régions de mes enfants, par exemple. J'en établis des courbes qui me permettent de savoir si on augmente ou diminue les "risques" sanitaires. Les chiffres en négatifs sont automatiquement inscrits en rouge (il y a parfois rattrapage de chiffres, comme ceux des tests positifs rectifiés (mai 21) après constatation de cas de plusieurs tests par les mêmes personnes). Lors de l'exploitation de ces données, je constate, comme pour le 05/02, une ligne entière de 0 (zéro); cela choque, et malgré plusieurs remises à jours des données recueillies sur le site, il n'y a pas de changement. Pour les tests déclarés positifs, il y a parfois des remises à jour plusieurs jours après les premières déclarations (résultats fournis tardivement, malgré que pour les départements, il y a déjà 3 jours de retard, alors que pour la France, ils sont donnés le jour même). Je réajuste donc les derniers chiffres. Effectivement, comme vous le dites, il peut y avoir décalage suite à l'exploitation retardée de données (après un WE), mais 0 décès dans toutes les régions le même jour, c'est la première fois depuis le début de cette pandémie, surtout si en plus ils donnent des chiffres très bas ou nuls pour les autres données (guérisons, tests positifs, réa, etc...) Dans le cas que j'ai signalé, le 04/02, il y avait une baisse important des cas nouveaux (hospitalisations, réa, décès, guérisons), dans toutes les régions, et le 08/02, il y a eu des chiffres très haut dans toutes les régions. Quand on voit les chiffres ligne par ligne, on s'aperçoit de "l'anomalie" immédiatement, ça saute aux yeux, comme on dit. Et sur les courbes, cela forme des pics! Michel

Chiffres 8 février 2023

Anthony Piton

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Posté le 10 février 2023

Chiffres 8 février 2023

Anthony Piton

—

Posté le 10 février 2023

Les chiffres du 8 février 2023 aboutissent à des résultats incohérents, les entrées étant tellement élevées que la moyenne glissante des entrées en hospitalisation passe du jour au lendemain de 282 à 707, et la moyenne glissante des entrées en réanimation passe du jour au lendemain de 25 à 71. Y a-t-il eu un rattrapage de données ? Si oui, cela ratrappe quelle période ? Je sais qu'en 2020 un hôpital avait donné en 1 jour ses données des deux derniers mois, ce qui avait faussé les chiffres. Merci, Anthony

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