Synthèse des indicateurs de suivi de l’épidémie COVID-19

Dans un contexte d’épidémie favorable, à compter du 1er juillet 2023, le cadre juridique actuellement en cours prévoit l’arrêt du traitement des données personnelles issues de SI-DEP. Par conséquent, après une période transitoire d’ajustement de deux semaines, les nouveaux indicateurs de surveillance virologique seront publiés aux niveaux national, régional et départemental) à une fréquence hebdomadaire.
Les consignes de saisie spécifiques dans SI-VIC seront levées à partir de cette date, les indicateurs hospitaliers ne seront plus disponibles.
Santé publique France maintient la surveillance de l’épidémie à travers son dispositif multi-sources. Les indicateurs relatifs à la surveillance génomique, aux recours aux associations SOS Médecins, aux urgences hospitalières et aux décès resteront disponibles.

INFORMATION 25/01/2023

Suite à une erreur de saisie, le nombre de décès survenus en semaine 03 en ESMS a été revu à la baisse. Les corrections nécessaires ont été apportées et expliquent la baisse artificielle du nombre de décès total survenus depuis le début de l’épidémie.

⚠️ 15/11/2022 Suite à la suspension de l’activité par une partie des Laboratoires de biologie médicale privés depuis le 14 novembre, le nombre de « Nouveaux cas confirmés depuis la veille » est sous-estimé à compter du mardi 15/11. De même le taux d’incidence et le taux de dépistage seront sous-estimés à compter du jeudi 17/11. Les équipes de Santé publique France restent mobilisées pour assurer le suivi de l’épidémie qui repose sur une surveillance multi-sources.

08/06/2022
Compte tenu de la tendance actuelle favorable et la baisse des principaux indicateurs, à partir du 11 juin 2022, les indicateurs COVID-19 produits par Santé publique France seront actualisés sur Géodes et data.gouv.fr tous les jours à l’exception des week-end et des jours fériés.

Description du jeu de données

Ce jeu de données comprends l'essentiel des indicateurs de synthèse permettant le suivi de l'épidémie de COVID-19 en France. Un inventaire des données relatives au COVID-19 sur data.gouv.fr est disponible ici.

Ces données sont notamment exposées sur l'onglet vue d'ensemble du tableau de bord de suivi de l'épidémie disponible sur gouvernement.fr. Ce dernier présente depuis le 28 mars 2020 les données relatives à l’épidémie de COVID-19 en France.

Cet outil dont le code source est libre, a été développé sous l’impulsion d’Etalab et avec la collaboration de la société civile. Il propose une vision consolidée des données officielles disponibles.

Description des données

Les données contenues dans le jeu de données sont publiées quotidiennement.

Données contextuelles :

• 'date' = Date

• 'dep'= Département

• 'reg'= Région

• 'lib_dep'= libellé département

• 'lib_reg'= libellé région

Données relatives à la situation hospitalière

• 'hosp'= Nombre de patients actuellement hospitalisés pour COVID-19.

• 'incid_hosp'= Nombre de nouveaux patients hospitalisés au cours des dernières 24h.

• 'rea'= Nombre de patients actuellement en réanimation ou en soins intensifs.

• 'incid_rea'= Nombre de nouveaux patients admis en réanimation au cours des dernières 24h.

• 'rad'= Nombre cumulé de patients ayant été hospitalisés pour COVID-19 et de retour à domicile en raison de l'amélioration de leur état de santé.

• 'incid_rad'= Nouveaux retours à domicile au cours des dernières 24h.

Données relatives au décès pour cause de COVID-19

• 'dchosp'= Décès à l’hôpital

• 'incid_dchosp'= Nouveaux patients décédés à l’hôpital au cours des dernières 24h.

• 'esms_dc'= Décès en ESMS

• 'dc_tot'= Cumul des décès (cumul des décès constatés à l'hôpital et en EMS)

Données relatives aux tests

• 'conf'= Nombre de cas confirmés

• 'conf_j1'= Nombre de nouveaux cas confirmés (J-1 date de résultats)

• 'pos'= Nombre de personnes déclarées positives (J-3 date de prélèvement)

• 'pos_7j' = Nombre de personnes déclarées positives sur une semaine (J-3 date de prélèvement)

• 'esms_cas' = Cas confirmés en ESMS

Données relatives aux indicateurs de suivi de l’épidémie de COVID-19

• 'tx_pos'= Taux de positivité des tests virologiques (Le taux de positivité correspond au nombre de personnes testées positives (RT-PCR et test antigénique) pour la première fois depuis plus de 60 jours rapporté au nombre total de personnes testées positives ou négatives sur une période donnée ; et qui n‘ont jamais été testées positive dans les 60 jours précédents.)

• 'tx_incid'= Taux d'incidence (activité épidémique : Le taux d'incidence correspond au nombre de personnes testées positives (RT-PCR et test antigénique) pour la première fois depuis plus de 60 jours rapporté à la taille de la population. Il est exprimé pour 100 000 habitants)

• 'TO'= Taux d'occupation : tension hospitalière sur la capacité en réanimation (Proportion de patients atteints de COVID-19 actuellement en réanimation, en soins intensifs, ou en unité de surveillance continue rapportée au total des lits en capacité initiale, c’est-à-dire avant d’augmenter les capacités de lits de réanimation dans un hôpital).

• 'R'= Facteur de reproduction du virus (évolution du R0 : Le nombre de reproduction du virus : c’est le nombre moyen de personnes qu’une personne infectée peut contaminer. Si le R effectif est supérieur à 1, l’épidémie se développe ; s’il est inférieur à 1, l’épidémie régresse)

Points d'attentions :

• Les méthodes de collecte des données ont évoluées dans le temps ;
• Au cours de l'été 2020, les données n'ont pas été publiées durant les week-end et jours fériés.

Ressources

• Consulter le tableau de bord
• Consulter l'inventaire des données relatives au COVID-19 sur data.gouv.fr
• Consulter les données de Santé publique France
• Consulter les données du ministère des Solidarités et de la Santé