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République
Française
Open Bio : base complète sur les dépenses de biologie médicale interrégimes
Description
Ce jeu de données provient d’un service public certifié
L’offre de données Open Bio est constituée d’un ensemble de bases annuelles, portant sur la consommation d’actes de biologie médicale en 2014 à 2024. Elle fournit des informations complémentaires au fichier BiolAM.
Toutes les données sont extraites du Système National des Données de Santé (SNDS).
Les données sur la biologie sont restituées de manière agrégée selon le groupe physiopathologique (GRP) auquel elles sont rattachées et de manière détaillée selon la nomenclature des actes de biologie médicale (ACTE).
Cette offre s’articule autour de deux types de jeux de données :
• Base complète sur les dépenses de biologie médicale interrégimes
Les premiers jeux de données Open_Bio 2014 à 2024 permettent d’étudier les dépenses annuelles de biologie médicale (montants remboursés – REM – et remboursables – BSE) ainsi que le dénombrement annuel des actes (DNB), en fonction d’éléments descriptifs sur les bénéficiaires (tranche d’âge, sexe, région de résidence selon la nouvelle nomenclature Insee) ou de l’information sur la spécialité du prescripteur, pour une année.
• Bases complémentaires enrichies des dénombrements de bénéficiaires
Les seconds jeux de données ont été constitués en compléments des bases Open_Bio 2014 à 2024 pour restituer le nombre de personnes ayant bénéficié d’actes de biologie médicale, au niveau agrégé du groupe physiopathologique ou au niveau plus détaillé de la nomenclature des actes de biologie médicale.
Ces fichiers sont préfixés par NB et l’année concernée. Puis, le suffixe indique d’une part le niveau de la nomenclature étudié (GRP : groupe ; ACTE : acte détaillé), d’autre part les critères de ventilation complémentaires.
Chaque année, seize bases sont constituées afin de répondre au besoin et de garantir le non double-compte des consommants.
- Producteur
- Licence
- License Not Specified
- Dernière mise à jour
- 2 décembre 2025
Certains fichiers ne sont pas disponibles
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17 discussions dont 1 clotûrée
Descriptifs variables avant 2024 (2020 et 2019 pour dépistage chlamydia et gonocoque)
Bonjour,
Je travaille dans le cadre de ma thèse sur les données concernant les examens de dépistage (chlam/gono).
A partir de 2020, les noms des variables changent (en 2021, on a 5301, 5302 et 5303 correspondant respectivement à 1/2/3 sites puis en 2020 il n'existe plus dans le titre de la variable la distinction entre 1/2/3 sites) et je n'ai pas le descriptif des variables des années antérieures à 2024. Pouvez-vous me confirmer qu'en 2020 et 2019, 5301 correspond bien toujours à 1 site ? 5302 2 sites ? 5303 3 sites ?
Merci d'avance,
Klervi ROCHOIS
Publication Données 2024
Bonjour,
J'aimerais savoir quand les données OPEN BIO 2024 seront disponibles?
Je vous remercie.
Cordialement,
Pauline Delubac
Bonjour Madame,
Je vous informe de la mise à disposition des données Open Bio 2024.
Cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour Madame,
Merci pour votre retour.
Savez-vous s'il est possible de récupérer le même niveau d'information au niveau départemental?
Quelle est la fréquence de diffusion de ces données (annuelle uniquement?)
Cordialement,
Pauline Delubac
Bonjour,
Pour des raisons de secret statistique, il n'est pas possible de fournir les données au niveau départemental.
La diffusion est annuelle uniquement.
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Etablissements de soins privés
Bonjour,
Sur le site web d'OpenBio, le périmètre des dépenses indique uniquement les soins de ville. En revanche, sur le site d'une autre base Biol'AM (Actes de biologie médicale par type de prescripteur), qui utilise la même source de données que'OpenBio, les établissements de soins privés sont également indiqués en plus des soins de ville. J'ai comparé les deux bases de données et je retrouve approximativement les mêmes chiffres.
Pourriez-vous m'indiquer si les établissements de soins privés sont inclus dans les données d'OpenBio ? Le cas échéant, cela inclut-il les données sur la consommation au sein de ces établissements ou cela ne concerne-t-il que les prescriptions provenant de ces établissements ?
Je vous remercie d'avance !
Bien cordialement,
Dans Open Bio, les prescriptions des professionnels de santé exerçant en cliniques privées sont prises en compte. Si l'examen biologique est effectué en clinique privée, il est également dans le périmètre Soins de ville.
Bien cordialement
Merci de votre réponse claire et rapide !
Bien cordialement,
Biolam mise à jour sept 2023 / Allergie
Bonjour,
Il semblerait que les tests d'allergie ont chuté presque au même niveau que durant le confinement pour la période du 2nd trimestre 2023 vs 2022.
N'y aurait il pas une erreur sur le jeu de donnée Biolam qui viennent d'être mise à jour pour cette partie ?
Merci
Bonjour,
Pouvez-vous me communiquer les codes actes concernés?
Bien cordialement
Actes en milieu Hospitalier
Bonjour
A priori les actes de biologie effectués en centre hospitalier public ne sont pas inclus dans ces données. Pouvez vous confirmer? et si tel est le cas pourriez vous m'orienter pour les obtenir? Merci
disponibilité des dénombrements de bénéficiaires
Apparemment comme indiqué dans d'autres commentaires les jeux de données complémentaires Open_Bio 2014 à 2020 permettant de restituer le nombre de personnes ayant bénéficié d’actes de biologie médicale ne sont pas disponibles.
Les fichiers préfixés par NB ne sont plus accessibles. C'est bien dommage car ils étaient très utiles pour différents projets. Que peut-on faire ? Merci d'avance
Bonjour,
vous retrouverez ces statistiques dans les rubriques "groupe" et "acte"
Bien cordialement
Bonjour et bonne année,
Je n'ai pas réussi à trouver les liens avec ces fichiers sur le site data.gouv (ou de la CNAm d'ailleurs) en revanche les liens vers les fichiers en question sont disponibles sur data.europa.eu... et les fichiers parfaitement téléchargeables, ce n'est donc qu'une question de présentation sur les sites nationaux. Merci encore
Disponibilités des bases NB 2020
Bonjour,
Dans le descriptif, il est noté "Les seconds jeux de données ont été constitués en compléments des bases Open_Bio 2014 à 2020 pour restituer le nombre de personnes...". Je remarque que pour 2020, seul le Open Bio 2020 est disponible et les jeux complémentaires n'ont pas été publiés. C'est bien dommage car avoir les données du nombre de patients est réellement primordial !
J'ai aussi d'ailleurs un autre problème de complétude sur le seul jeu de données qui est disponible, il est complètement incomplet sur le SARS Cov2. Si il y a bien l'air d'y avoir une cohérence par rapport à la réalité sur le montant des dépenses du "FORFAIT DE TRAITEMENT DES DONNNEES ADMINISTRATIVES DU COVID-19", les montants des actes eux mêmes sont complètement incohérents et je ne trouve que 1,2 millions de dépistage du SARS COV-2 sous toutes ses formes (PCR et AG)...
J'ai retrouvé mon SARS-COV2. Désolé, il y en a bien 1,3 Milliards... C'est cohérent. Il ne me manque que les fichier REG et NB qui sont très intéressant.
Disponibilité Open Bio
Bonjour,
Nous attendons impatiemment les données de 2020 ! Quand pensez-vous qu'elles seront disponibles ?
Bonjour,
les données Open BIO 2020 sont disponibles.
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Etude des actes en psychiatrie
Bonjour,
Dans le cadre d'une étude concernant les impacts de l'épidémie de covid-19 sur la santé mentale des français, cette base peut-elle être utile en filtrant PSP_SPE=17 (prescripteur = psychiatrie) ?
On a par exemple les actes suivants :
- Détection du génome SARS-COV-2 (quel est le lien avec un acte de psychiatrie ?)
- Forfait de prise en charge pré-analytique du patient (ce forfait comprend...?)
- Forfait du traitement des données administratives du covid-19
Pouvez-vous me renseigner plus précisément sur ce à quoi correspondent ces actes ? Et s'ils peuvent m'aider dans mon étude
Cordialement,
Louisa Camadini
Réconciliation OpenBio/ dépenses UNCAM en historique
Bonjour,
Je cherche à réconcilier les chiffres publiés par l'UNCAM sur les dépenses de biologie médicale avec ceux présentés dans OpenBio.
Par exemple pour 2016 :
> 4,65 Md dans OpenBio en BSE dont 3,59 Md de REM (coût sécurité sociale)
> Contre 3,70 Md d'enveloppe allouée dans l'accord triennal 14-16 pour 2016 et 3,73 constatés
Le 3,59 REM OpenBio devrait en théorie correspondre aux chiffres de l'UNCAM : pouvez-vous m'indiquer quelles sont les sources de l'écart (méthodologie, périmètre des tests pris en compte, périmètre de régimes pris en compte, etc.) ?
Merci pour votre attention !
Cordialement
Voici le périmètre d'Open Bio :
Données Actes de biologie médicale
Champs Tous les régimes d’assurance maladie
Période couverte 2014 à 2019
Périodicité des données Annuelle
Couverture géographique France entière
Granularité géographique Région
Fréquence de mise à jour Annuelle
Source Sniiram
Licence Licence Ouverte / Open Licence
Mise à jour des données
Nous sommes en avril 2020 et les données de 2019 ne sont toujours pas disponibles alors que d'habitude, elle sont publiées en mars. Avez-vous une idée de la prochaine date de publication ? Merci.
Bonjour,
nous rencontrons des problèmes techniques qui retardent la production des données 2019 Open Bio.
Nous n'avons pas une visibilité certaine sur la date de mise en ligne, mais tâchons de faire au mieux.
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour,
Les données Open Bio 2019 sont disponibles.
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour, Je viens de regarder. C'est presque parfait. Néanmoins, j'ai un problème avec la feuille descriptif des données. L'année dernière, cette feuille contenait un onglet ACTE qui listait tous les codes nomenclatures (la NABM quoi) mais avec les codes pour presque toutes les années. A ce jour, le descriptif des données contient de nombreux onglets actes avec des médicaments, mais plus du tout avec la nomenclature de biologie...
Est-ce une erreur de fichier ?
Bonjour,
Avez-vous une date indicative de disponibilité de la base 2020?
Par ailleurs savez-vous s'il est possible de distinguer systématiquement les actes de routine et les actes de spécialité sur la base ?
Merci par avance,
Thibault
La base arrive en général en avril ou mai, sauf en 2020 pour 2019 ou c'est arrivé en octobre.
La dénomination "acte de spécialité" est abusive. Il s'agit d'un acte sous-traité par le laboratoire qui prend en charge le patient. Prenons l'exemple de la Vitamine D qui a été longtemps un acte de spécialité, quand les industriels Roche, Siemens,... ont sortis leurs trousses "Vitamine D" pour les automates les plus présents dans les laboratoires de première intention, cet acte n'a plus été un acte de spécialité du jour au lendemain. Plus généralement, un acte qui est de la spécialité dans le LABO A peut être un acte de routine dans le LABO B si ce labo dispose de la technologie adéquate. La PCR a longtemps été un acte de spécialité, les volumes étant trop faibles pour les laboratoires de routine. Avec le COVID, les laboratoires de routine disposent presque tous maintenant d'automates de PCR et ont/vont probablement réinternalisé toute la PCR. Il est probable que la majorité des dépenses de PCR présentes en 2019 aient été de la spécialité et deviendront de la routine en 2021 ou 2022 (actuellement les automates PCR en routine sont encore dédié au COVID).
Merci Monsieur Payeur pour votre retour,
Bien à vous
Thibault
Requête de données complémentaires
Bonjour, pourriez vous transmettre les bases complémentaires enrichies des dénombrements de bénéficiaires dans un format Excel (et non .gz comme on peut les trouver ailleurs) ? Merci beaucoup d'avance
Bonjour,
je suis disposée à vous transmettre les fichiers Open-Bio en format excel.
Comment voulez vous que l'on procède pour cette mise à disposition?
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Merci de votre retour
Pourriez vous me les envoyer par email ? N'hésitez pas à me contacter directement à l'adresse utilisée pour mon compte data.gouv. Je rajoute 1 question : pourriez-vous me confirmer que la nomenclature détaillée biologie médicale (ACTE) est la même sur les fichiers 2014-2018 que sur les plus anciens (2006-2013) ? Merci beaucoup d'avance
Pouvez-vous me communiquer votre adresse mail afin que je procède au transfert?
Merci
Evelyne TOUSTOU
Y a-t-il un moyen que je vous communique mon adresse email sur une conversation privée?
Bonjour, vous pouvez me communiquer votre adresse email via la boite générique
snds.cnam@assurance-maladie.fr
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour Evelyne,
Je n'ai pas reçu les documents pour l'instant - et j'aimerais vous poser 1 question dont la réponse me serait d'une grande aide ! Qu'entend-on par "prescripteur salarié" ?
Bonjour,
la modalité "prescripteur salarié" correspond pour l'essentiel aux prescriptions des hôpitaux publics et des centres de santé.
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Merci beaucoup pour votre réponse
Encore une question : à quoi correspondent éxactement les "dispositions générales" (groupe 29 dans les données) ?
Merci encore!
Et autre question : le champ des données 2018 est-il limité aux dépenses de biologie médicale du régime général ou comprend-il le régime agricole / des indépendants / spéciaux ? Merci
L open Bio couvre l'ensemble des régimes d'Assurance Maladie
Bonjour Madame,
J'aurais deux petites questions concernant la base de données Open Bio
1. Pourquoi est ce qu'il existe une différence sur la colonne BSE en année 2017 entre les fichiers 2017 Acte (4 669 244 310) et Open Bio 2017 (4 669 186 995)
2. Est ce que vous sauriez la différence entre les chiffres Open Bio 2017 (4 669 186 995) et le chiffre donné par DREES ( 4 466 000) p.152 au niveau du document suivant (https://drees.solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/cns2019.pdf)
Merci par avance pour votre aide,
Bien cordialement,
Amine
Bonjour,
Merci pour toutes ces informations!
Par ailleurs, pourriez-vous me préciser ou indiquer la définition de: REM, BSE, et PSP_SPE ?
Cordialement,
Bonjour,
1- Il existe effectivement une légère différence entre la base complète Open Bio et les bases complémentaires. Cela est dû au processus d'anonymisation.
2- Je ne connais pas l'explication de différence entre les données Open Bio et le chiffrage de la DREES
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour,
voici les définitions demandées:
BSE: il s'agit de la base de remboursement. Cette base de remboursement correspond au tarif opposable pour le remboursement par l4assurance Maladie. Elle est notamment hors dépassements pratiquées par le professionnels de santé
REM: il s'agit du montant remboursé après application du taux de remboursement sur la base de remboursement.
On a REM=BSE*taux de remboursement
PSP_SPE
Il s'agit de la spécialité du professionnel prescripteur.
Par exemple si un généraliste prescrit des actes de kinésithérapie: pour ces actes ,on aura PSE_SPE= kiné et PSP_SPE=généraliste
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour Madame Toustou,
Merci pour ces réponses très riches. Avez-vous plus d'informations sur les différences entre le chiffrage open Bio et celui de la DREES évoqué plus haut ? Auriez-vous sinon un contact à la DREES qui pourrait nous renseigner sur la source de cet écart ?
Par ailleurs, ces données incluent-elles les dépenses de biologie médicale réalisées dans les hôpitaux publics ? Ou s'agit-il seulement des laboratoires privés (cliniques et labos de ville) ?
Merci beaucoup
Bonjour Monsieur Bovet,
je n'ai pas d'éléments de réponse à vous apporter concernant les différences de chiffrage Open Bio/DREES et n'ai pas d'interlocuteur à qui m'adresser.
Les données Open Bio n'incluent pas les dépenses de biologie médicale réalisées dans les hôpitaux publics. Il s'agit effectivement de l'activité des laboratoires privés (cliniques et laboratoires de ville).
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Merci beaucoup pour ce retour rapide et très clair.
Je me permets de vous poser une autre question complémentaire : pourriez-vous nous confirmer que les données Open Bio incluent dans le BSE les montants des participations forfaitaires payées par les patients ?
La BSE n'est effectivement pas défalquée de la participation forfaitaire des assurés
Bonjour,
Quand seront disponibles les données open BIO de 2020 svp ?
Disponibilité données 2019
Bonjour,
Merci pour les données déjà publiées.
Savez vous quand serons disponibles les données de l'année 2018 ?
Bien cdlmt,
Florian Scherrer
Bonjour Monsieur,
les données Open Bio 2018 sont accessibles à ce jour sur data.gouv
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Merci ++
Bonjour,
Comment puis je vous contacter si une ligne d'examen me semble erronée ?
Bien cdlmt,
FS
Bonjour,
pouvez-vous me préciser le problème rencontré sur ce forum?
Je tâcherai de vous apporter une réponse.
Bien cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour,
Il a l'évolution d'une ligne d'analyse (en terme de volume) que je ne confirme pas dans mon activité ni dans celles de nombreux autres laboratoires.
C'est l'"anomalie" (avec toutes les précautions préalables qui s'imposent) suivante :
- En 2018, la somme des actes 5257 et 5301 (852 124 + 423 718 = 1 275 842) : le test a changé de code AREM en cours d'année (le 29 Juin 2018 précisément) d'où la somme.
- En 2017, l'acte 5257 est dénombré 1 436 030 fois. Le code 5301 n'existait pas.
Bonjour,
Je n'ai pas eu de retour sauf erreur de ma part.
Bonjour,
Je me permets de vous relancer svp. Merci d'avance.
Bonjour,
Il faut que je m'adresse à un expert du domaine.
Je vais faire mon possible pour vous apporter une réponse à cette problématique pointue.
Je ne perds pas de vue votre questionnement
Cordialement
Evelyne TOUSTOU
Bonjour,
J'espère que vous avez passé de bonnes vacances. Je me permets de revenir vers vous.
Florian
Bonsoir,
Je regrette de ne pas avoir de réponse sur ce sujet.
Bien cdlmt
Lieux de réal
Bonjour,
pouvez-vous me confirmer que ces données incluent les dépenses de biologie des cliniques privées?
Merci
Bonjour Madame,
je vous confirme que les données Open Bio incluent les dépenses de biologies exécutées en cliniques privées.
Bien Cordialement
Evelyne TOUSTOU
biologie hospitalière
Bonjour,
Les données sont intéressantes. Où peut on trouver les mêmes données pour la biologie hospitalière?
D'avance merci
Bonjour,
Nous n'avons pas pour l'instant prévu de publier les données équivalentes pour les actes de biologie, mais nous allons y réfléchir. Merci pour votre suggestion et l'intérêt que vous portez à nos publications. Hélène Caillol
OPEN BIO 2017
Bonjour
J'aimera savoir quand les données open bio 2017 seront disponibles SVP ?
Bonjour, nous prévoyons une publication des données 2017 pour Open Medic, Open PHMEV et Open Bio la semaine prochaine, sous réserve des dernières vérifications. Bien cordialement, Hélène Caillol
BONJOUR savez-vous s'il est prévu de présenter ces données avec le détail mois par mois ou trimestre par trimestre SVP?
Data Open Bio
Discussion close par 
DELETED DELETED le 9 mars 2018
DELETED DELETED le 9 mars 2018