L'évaluation de l'état chimique des masses d'eau de surface naturelles est basée sur une échelle à deux niveaux (bon, mauvais). L'évaluation de l'état chimique réalisée en vue du troisième plan de gestion repose sur la liste des substances de la directive 2008/105/CE et les normes de qualité environnementale de la nouvelle directive 2013/39/UE. L'évaluation sans prise en compte des substances dites ubiquistes permet d'avoir une image plus différenciée de la situation actuelle.
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