Données de laboratoires pour le dépistage, focus par niveau scolaire SI-DEP

⚠️ 15/11/2022 Suite à la suspension de l’activité par une partie des Laboratoires de biologie médicale privés depuis le 14 novembre, le nombre de « Nouveaux cas confirmés depuis la veille » est sous-estimé à compter du mardi 15/11. De même le taux d’incidence et le taux de dépistage seront sous-estimés à compter du jeudi 17/11. Les équipes de Santé publique France restent mobilisées pour assurer le suivi de l’épidémie qui repose sur une surveillance multi-sources.

Les indicateurs de surveillance virologique sont issus du système d’information de dépistage (SI-DEP), dont l’objectif est de remonter les données de tests (RT-PCR) réalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2, ainsi que les tests antigéniques réalisés par les laboratoires, pharmaciens, médecins et infirmiers.

Précisions :
La sélection de la première date avec pcr positive si plusieurs prélèvements positifs pour un même patient.

Jeux de données disponibles
sp_18ans_fra ; sp_18ans_reg : sp_18ans_dep : Taux d'incidence, de positivité et de dépistage hebdomadaire, respectivement pour la France, par région et par département

sp_ti_tp_7j_18ans_fra ; sp_ti_tp_7j_18ans_reg ; sp_ti_tp_7j_18ans_dep : Taux d'incidence, de positivité et de dépistage sur 7 jours glissants, respectivement pour la France, par région et par département

Variables
Les classes d’âge ont été construites en fonction des niveaux scolaires, à savoir :
[0] Tous âges
[02] Avant 3 ans - Petite enfance
[05] De 3 à 5 ans - Maternelle
[10] De 6 à 10 ans - Primaire
[14] De 11 à 14 ans - Collège
[17] De 15 à 17 ans - Lycée
[18] 18 ans et plus

Pour chaque catégorie, tous les enfants sont inclus jusqu’à l’âge révolu. Par exemple, pour le niveau maternel, les enfants de 3 ans jusqu’à 5 ans et 11 mois sont inclus. Par contre les enfants de 6 ans sont classés dans le niveau « primaire ».

ti : Le taux d'incidence hebdomadaire rapporté à la population pour 100 000 habitants, par semaine calendaire.
tp : Le taux de positivité hebdomadaire rapporté 100 tests réalisés, par semaine calendaire.
td : Le taux de dépistage hebdomadaire rapporté à la population pour 100 000 habitants, par semaine calendaire.

Données disponibles par départements, régions et France.

Limites :

• Seuls les tests biologiques des personnes pour lesquelles le département de résidence est disponible sont représentés sur les cartes. Les personnes dont le département n’est pas renseigné dans les données SI-DEP ne sont comptabilisées qu'au niveau France entière. De ce fait, la somme des nombres de tests indiqués dans les départements ou régions est inférieure au nombre total de tests indiqué pour la France entière.
• Seuls les tests biologiques des personnes pour lesquelles l’âge est renseigné sont disponibles. Les personnes dont l’âge est manquant ne sont comptabilisées qu’au niveau de la France entière. De ce fait la somme des tests indiqués dans les départements ou régions est inférieure au nombre total de tests indiqué pour la France entière.