Données de laboratoires pour le dépistage (A COMPTER DU 18/05/2022) - SI-DEP

Description

Dans un contexte d’épidémie favorable, à compter du 1er juillet 2023, le cadre juridique actuellement en cours prévoit l’arrêt du traitement des données personnelles issues de SI-DEP. Par conséquent, après une période transitoire d’ajustement de deux semaines, les nouveaux indicateurs de surveillance virologique seront publiés aux niveaux national, régional et départemental) à une fréquence hebdomadaire.
Les consignes de saisie spécifiques dans SI-VIC seront levées à partir de cette date, les indicateurs hospitaliers ne seront plus disponibles.
Santé publique France maintient la surveillance de l’épidémie à travers son dispositif multi-sources. Les indicateurs relatifs à la surveillance génomique, aux recours aux associations SOS Médecins, aux urgences hospitalières et aux décès resteront disponibles.

🆕 AJOUT 06/09/2022
Mise à disposition de l'historique des données pour la couche IRIS.
Un fichier par mois de données.

⚠️ MAJ 09/08/2022
Santé publique France met à jour les référentiels géographiques et de population, utilisés pour la production et la diffusion des indicateurs de suivi de l’épidémie de COVID-19. Cette actualisation sera effective le 7 juillet 2022 . Elle est amenée à être renouvelée chaque année.
De ce fait, certains intitulés de champs seront corrigés à compter du 10 août 2022 :

  • Pour les fichiers sp_metro_* : epci2020 devient epci
  • Pour les fichiers sp_iris_* : iris2019 devient iris

08/06/2022 Compte tenu de la tendance actuelle favorable et la baisse des principaux indicateurs, à partir du 11 juin 2022, les indicateurs COVID-19 produits par Santé publique France seront actualisés sur Geodes et data.gouv.fr tous les jours à l’exception des week-end et des jours fériés.

🆕 A COMPTER DU 18/05/2022, le format des ressources issus des données de laboratoires pour le dépistage (SI-DEP) évolue.

Quelles données ? :
Les indicateurs de surveillance virologique sont issus du système d’information de dépistage (SI-DEP), dont l’objectif est de remonter les données de tests (RT-PCR) réalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2, ainsi que les tests antigéniques réalisés par les laboratoires, pharmaciens, médecins et infirmiers.

➡️ L'ensemble des tables et des variables qui les composent, ainsi que le descriptif des modifications sont consultables dans la note méthodologique datée du 12/05/2022 disponible ici

Dernière mise à jour
30 juin 2023

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Qualité des métadonnées:
Bon(78 %)
  • Fréquence de mise à jour non respectée

  • Couverture temporelle non renseignée

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8 discussions

donnée incidence par commune entre la mise à jour du 18 mai 2022 et maintenant

Posté le 24 août 2023
Bonjour, J'ai besoin pour une étude, des taux incidences par commune durant toute l'épidémie covid. Du début au 07/03/2022, les données sont archivées jour après jour (https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/old-donnees-de-laboratoires-infra-departementales-durant-lepidemie-covid-19/#/resources) Mais ensuite, les données sont ici, mais ne sont pas archivées puisque seul le dernier est disponible (sp-com-7j-opendata-2023-06-30-16h28.csv). Où peut-on trouver les données entre 07/03/2022 et 30/06/2023 ? Cordialement

Données 7j bloquées au 23/09

Posté le 27 septembre 2022
Bonjour, nous n'avons pas de nouvelles données depuis le 23/09/2022. Savez-vous quand le flux sera remis en place? Cordialement.

Données cage absente depuis le 6 juillet

Posté le 11 juillet 2022
Les dernières données cage datent du 6 juillet, veille de la mise à jour du 7 juillet sur les référentiels géographiques et de population. A quoi cela sert de mettre à jour les données de population si cela signifie de de pas les produire du tout ? Ce serait mieux de revenir à l'ancien référentiel et de fournir les données. Que comptez-vous faire ?

Données incompréhensibles ...

Posté le 16 juin 2022
J'essaie d'exploiter les données de "sp-reg-jour-2022-06-15-19h00.csv" L'ancienne version était parfaitement claire, mais là ... Un taux de positivité qui monte à plus de 400 000 alors qu'il s'agit d'un pourcentage la colonne "cl_age90" qui n'a plus les tranches d'âge comme avant et qui atteint 1381 Pourquoi avoir changer ?
Posté le 16 juin 2022
J'ai pu trouver des données exploitables avec le fichier : sp-reg-jour-cage10-2022-06-15-19h01.csv

Solidarité Covid - Français de Chine

Posté le 12 juin 2022
Bonjour, Pour la mise à jour de notre dashboard démographique COVer-AGE-DB, je suis à la recherche des indicateurs P_F P_H, soit les cas positifs par sexe et tranche d'âge de 10 ans. Je ne trouve pas ces champs dans les nouveaux fichiers mis en place le 18 mai. je ne trouve pas non plus les derniers fichiers de l'ancien lien... Plus d'information sur notre travail sur www.solidaritecovid.com

Valeurs bizarres dans colonne 'pop'

Posté le 5 juin 2022
Bonjour, Les valeurs des colonnes 'pop' me semble bizarres. Par exemple, dans sp-fra-jour au 04/06, la valeur de la population est 6 711 499 200 (6 milliards et 7 millions), je suspecte une erreur dans l'agrégation au niveau des différentes échelles. Bien à vous,

Fichier du 31 mai s arrête au 22 mai

Posté le 1 juin 2022
sp-dep-7j-2022-05-31-19h00.csv ne contient pas de données au delà du 22 mai .
Posté le 1 juin 2022
Oups, j ai mal interprété les données. Supprimer ce message svp.

Données SI-DEP infradépartementales pour les mois de mars et avril 2022

Posté le 19 mai 2022
Bonjour, Pourriez-vous, s'il vous plait, indiquer où sont publiées les données SI-DEP infradépartementales pour les mois de mars et avril 2022? Ces données ne figurent pas à la pagé dédiée, antérieure aux modifications datant du 18/05/2022 https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-de-laboratoires-infra-departementales-durant-lepidemie-covid-19/#community-resources Cordialement,