La Tâche d’Observation vise à mieux comprendre (I) les interactions entre l’environnement et la dynamique des communautés planctoniques, mais aussi (II) les interactions entre communautés, (III) le tout dans un contexte de changement global avec un écosystème ciblé très fortement exposé à la fois aux forçages anthropiques et aux changements climatiques.
Communautés microbiennes de Thau
Observations
La station échantillonnée dans le cadre de l’OSU OREME se trouve sur la lagune de Thau, en face de la Station Méditerranéenne de l’Environnement Littoral (SMEL) de Sète.
Cette station a non seulement été choisie pour des raisons pratiques (accès), mais surtout car elle présente une signature lagunaire caractéristique. De plus, son éloignement des tables conchylicoles environnantes permet de se soustraire au biais d’échantillonnage induit par la pression de filtration des bivalves. Les nombreux programmes d’échantillonnage qui y ont été menés depuis la fin des années 30 permettent d’avoir accès à une série temporelle importante sur cette station, qui renforce la pertinence de l’analyse des données acquises.
L’échantillonnage régulier de la station a été ré-initié par Delphine Bonnet en 2008 et pérennisé jusqu’à décembre 2011 par des contrats de recherche, notamment le projet GELAMED sur le plancton gélatineux (2010-2012, programme Liteau III). Depuis le début de l’année 2013, l’échantillonnage bimensuel de la station est mené dans le cadre du suivi OSU OREME et permet l’analyse de différents paramètres environnementaux et biologiques :
- Température, salinité, profondeur et turbidité
- Sels nutritifs
- Abondance totale des bactéries et HNA (High Nucleic Acid) /LNA (Low Nucleic Acid)
- Abondances du pico-phytoplancton, cyano-bactéries, nano-phytoplancton
- Abondance totale des communautés virales
- Abondance et diversité des communautés mésozooplanctoniques
- Abondance et diversité des communautés proto-zooplanctoniques: flagellés et ciliés
- Abondance et diversité des communautés nano- and microphytoplanctoniques
- Analyse de la chlorophylle a
- ADN planctonique total: une banque d’ADN planctonique total a été créée. Deux exemplaires de chaque triplicat réalisé sont conservés à -30°C et disponibles pour analyse pour tout collègue intéressé par un suivi de ce type. Les échantillons sont envoyés sur demande (Contacter Corinne Bouvier).
Variables Essentielles de Biodiversité : Taxonomic diversity, Population abundance
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- Delphine Bonnet (Biodiversité marine et ses usages)